Biological Network Exploration Tool: BioNetXplorer

Published in: Innovation in Engineering, Technology and Education for Competitiveness and Prosperity: Proceedings of the 12th Latin American and Caribbean Conference for Engineering and Technology
Date of Conference: July 21-24,2014
Location of Conference: Guayaquil,Ecuador
Authors: Carlos Roberto Arias Arévalo
Refereed Paper: #60

Abstract:

BioNetXplorer is a standalone application that allows the integration of more than twenty topological and biological properties of the nodes of a biological network, and that displays them in a intuitive, easy to use interface. Along this functionality the application can also perform graphical shortest paths analysis and shortest paths scoring of genes, due to the intensive computational requirement of the later it has the potential to connect to a Hadoop cluster for faster computation.

Resumen:

BioNetXplorer es una aplicación de escritorio que permite la integración de más de veinte propiedades topológicas y biológicas de los nodos de una red biológica, mostrando esta información en un interfaz intuitivo y fácil de usar. Además de esta funcionalidad la aplicación también realiza análisis de caminos más cortos de manera gráfica, y la evaluación de puntuación de genes por medio de caminos más cortos. Debido a las necesidades intensivas de computación de esta última funcionalidad el software tiene el potencial de conectarse a un clúster de Hadoop para computación más rápida.